Церковь в Субботах (ранее называвшаяся Малая Торокань) была построена в 1797 году базилианскими монахами из Тороканского монастыря (ныне деревня Именин).
Описание даты строительства доступно в «Описаниях церквей и приходов. Гродненский православный церковный календарь. Том 1». Стоит отметить, что в 1899 году к этой церкви были приписаны уже 2 церкви из Именина и Лосинца. Первая, вероятно, была приписана из-за упадка Базилианского монастыря после Полоцкого собора.
После Полоцкого собора эта церковь перешла к православным. Указом № 14711 Святейшего Синода от 23 декабря 1897 года Субботская приходская церковь Рождества Богородицы была переименована из Тороканской.
Во времена II Речи Посполитой (1919–1939) церковь действовала. Это подтверждается её отметкой на картах и фотографиями её недавнего ремонта.
В настоящее время церковь находится в хорошем состоянии и действует. К сожалению, метрических книг этой церкви нет, а также нет записей об униатских или православных священнослужителях до 1918 года.